Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim34bJ3QNR8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim34bJ3QNR8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trim34bJ3QNR8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim34bJ3QNR8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms