Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm21972J3QN38 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm21972J3QN38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm21972J3QN38 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms