Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Zfp616J3QN14 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zfp616J3QN14 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp616J3QN14 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms