Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20873J3QMQ9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm20873J3QMQ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Gm20873J3QMQ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Gm20873J3QMQ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20873J3QMQ9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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