Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm6176J3QK59 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm6176J3QK59 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms