Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm20830J3KML6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20830J3KML6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms