Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf148G3X9R7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf148G3X9R7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf148G3X9R7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.4 ms