Protein–RNA interactions for Protein: G3X992

Msl3l2, MSL3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl3l2G3X992 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Msl3l2G3X992 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msl3l2G3X992 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msl3l2G3X992 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms