Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zkscan2G3X952 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zkscan2G3X952 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Zkscan2G3X952 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms