Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Vmn1r39G3UWE6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vmn1r39G3UWE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmn1r39G3UWE6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms