Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl26F8VQM2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccl26F8VQM2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl26F8VQM2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms