Protein–RNA interactions for Protein: F8VQK7

Gm16519, Predicted gene, 16519, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16519F8VQK7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm16519F8VQK7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm16519F8VQK7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm16519F8VQK7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms