Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ScaperF8VQ70 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ScaperF8VQ70 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ScaperF8VQ70 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms