Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4aF8VPX6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4aF8VPX6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4aF8VPX6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms