Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3371F7CQW8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3371F7CQW8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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