Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm28038F7BCN9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm28038F7BCN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms