Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
D430041D05RikF6ZGR6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
D430041D05RikF6ZGR6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
D430041D05RikF6ZGR6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
D430041D05RikF6ZGR6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms