Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm8005F6YKY3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm8005F6YKY3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm8005F6YKY3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms