Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pagr1bF6V0H0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pagr1bF6V0H0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pagr1bF6V0H0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms