Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm17430F6RSK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms