Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cald1E9QA15 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cald1E9QA15 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cald1E9QA15 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cald1E9QA15 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms