Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rdh16f1E9Q9P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Rdh16f1E9Q9P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rdh16f1E9Q9P8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rdh16f1E9Q9P8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rdh16f1E9Q9P8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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