Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mcmdc2E9Q956 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mcmdc2E9Q956 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mcmdc2E9Q956 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mcmdc2E9Q956 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms