Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Urb2E9Q7L1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Urb2E9Q7L1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Urb2E9Q7L1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms