Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde8bE9Q4S1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde8bE9Q4S1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pde8bE9Q4S1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pde8bE9Q4S1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde8bE9Q4S1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms