Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ApobE9Q414 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ApobE9Q414 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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