Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt90E9Q1Z0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt90E9Q1Z0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt90E9Q1Z0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms