Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrp3E9Q1T6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp3E9Q1T6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp3E9Q1T6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms