Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3893E9Q1I1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3893E9Q1I1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3893E9Q1I1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3893E9Q1I1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms