Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdr1E9Q0B4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cdr1E9Q0B4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdr1E9Q0B4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms