Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Fndc1E9Q043 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Fndc1E9Q043 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fndc1E9Q043 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms