Protein–RNA interactions for Protein: E9PZF0

Gm20390, Nucleoside diphosphate kinase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20390E9PZF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm20390E9PZF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm20390E9PZF0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20390E9PZF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20390E9PZF0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20390E9PZF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20390E9PZF0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms