Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ9

Pdzrn4, PDZ domain-containing RING finger 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn4E9PUZ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzrn4E9PUZ9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzrn4E9PUZ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pdzrn4E9PUZ9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms