Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930455H04RikD3Z622 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4930455H04RikD3Z622 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4930455H04RikD3Z622 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms