Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3676D3Z236 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3676D3Z236 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.3 ms