Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnf217D3YYI7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf217D3YYI7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf217D3YYI7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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