Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc170D3YXL0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc170D3YXL0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc170D3YXL0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms