Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SafbD3YXK2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SafbD3YXK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SafbD3YXK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SafbD3YXK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SafbD3YXK2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms