Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9230113P08RikD3YWX3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.27■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9230113P08RikD3YWX3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms