Protein–RNA interactions for Protein: B9EHI3

1700006A11Rik, 1700006A11Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700006A11RikB9EHI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
1700006A11RikB9EHI3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700006A11RikB9EHI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700006A11RikB9EHI3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1700006A11RikB9EHI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
1700006A11RikB9EHI3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
1700006A11RikB9EHI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms