Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71aB7XG49 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Fam71aB7XG49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71aB7XG49 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms