Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trappc11B2RXC1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trappc11B2RXC1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc11B2RXC1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc11B2RXC1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms