Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Siah3B2RWG3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Siah3B2RWG3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms