Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cfap58B2RW38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cfap58B2RW38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms