Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Slc22a28B2RT89 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms