Protein–RNA interactions for Protein: B2RPV6

Mmrn1, Multimerin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmrn1B2RPV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmrn1B2RPV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmrn1B2RPV6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms