Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H60cB1B213 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H60cB1B213 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H60cB1B213 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H60cB1B213 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H60cB1B213 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H60cB1B213 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H60cB1B213 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms