Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PtpruB1AUH1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PtpruB1AUH1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpruB1AUH1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms