Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Skint2A7XUX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Skint2A7XUX6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Skint2A7XUX6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms