Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc9bA3KGF9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc9bA3KGF9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc9bA3KGF9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms